Aparat rezonansu magnetycznego wykorzystuje silne pole magnetyczne do bardzo dokładnego obrazowania tkanek. Ilość pozyskanych danych w jednostce czasu jest zależna od indukcji pola (najczęściej spotyka się aparaty o indukcji 1,5 lub 3T). Aparaty o indukcji 3T pozyskują w tym samym czasie znacznie większą ilość danych pozwalając na dokładniejsze obrazowanie i skrócenie badania, aczkolwiek ze względu na wytwarzane pole magnetyczne jest przeciwwskazany osób, u których u wszczepiono różnego rodzaju aparaty lub metalowe implanty.

Badanie rezonansem magnetycznym nie jest tanie ze względu na koszty związane z zakupem i instalacją urządzenia, koszty serwisu, stosunkowo długi czas potrzebny do przeprowadzenia i opisania pojedynczego badania, a także na wysokie koszty eksploatacyjne. Aparat podczas badania wskazuje pobór prądu na poziomie 20.000 W, a wyłączony 5.000 W – ze względu na konieczność stałego chłodzenia. Jednak w zamian za to uzyskuje się obrazy o jakości niedostępnej w innych technikach obrazowania i jednocześnie bez użycia szkodliwego promieniowania rentgenowskiego (jak np. w tomografii komputerowej).

W NCM badania wykonuje się na dwóch aparatach:

•  1,5T – Dom Medyczny „Polanki” Gdańsk
•  3T (otwór 70 cm) – Dom Medyczny „Świętokrzyska” Gdańsk

wyposażonymi w dedykowane cewki pozwalającymi na najwyższą jakość badań.